Rosalind,一個在線學習生信的網站 ?

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樓主 2019-10-24 16:05:02
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做生物信息學需要三類技能:生物學知識、統計學知識、編程能力。


我們在學習生物信息學時,有很大一部分內容是學習解決特定的問題。基礎的序列比對、相關格式文件的處理、數據統計和可視化等等。這些問題往往需要編程解決,于是就有了這樣的問題:我們應該如何增強相關的技能水平?答案是,我們需要練習。

我們練習計算機學科的基礎算法時,也會做大量的練習,這跟我們做數學習題是同樣的道理。一般來說,會有一個在線的網站,羅列了難度各異的各種題目。每道題目會描述一個需要解決的問題,然后給出指定的輸入。我們需要做的,就是根據題目表述進行編程,然后用程序計算給定的輸入數據集,得出答案。

這樣的一個在線學習平臺有一個固定的名字:Online Judge。至此,我們要問,是否有一個關于生物信息算法的在OJ,可以提供一些有趣的問題,讓我們練習我們解決生物信息問題的能力呢?答案是肯定的,這個網站就叫做 Rosalind。下面是關于這個網站的一些介紹。


上圖是 Rosalind 上提供的不同類別的題目。


上面是 Rosalind 的題目列表。并非所有的題目一開始就完全開放,我們必須做完某些固定的題目,然后才會開放一些后續題目。這樣的安排有利于我們學習知識的循序漸進。


我們還可以看到自己的學習進度、獲得的成就、技能等級等等。是不是有一種玩游戲升級通關的感覺呢 :)。學習本來就應該有游戲一般的樂趣嘛。

除此之外,Rosalind 上還有全世界各個地方的人,大家可以就某個問題進行討論和交流,相互學習。美國很多大學的生信課程也是用 Rosalind 作為課程的習題網站。看到這里是不是心動了?不如現在就注冊一個賬號開始做題吧。

原文:知因

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